Ricardo,
Você só pode associar mais de um fluxo ao projeto se for associá-lo à issuetypes diferentes. Se a ideia é associar dois fluxos de trabalho à uma mesma issuetype, isso não é possível.
Se você já tiver uma issuetype no projeto que vai receber este novo fluxo, para associar o fluxo à esta issuetype, siga este caminho:
Acesse as configurações do projeto;
Vá até Workflows;
Você verá a opção "Add workflow". Clique nela e o Jira irá exibir todos os workflows disponíveis. Neste passo recomendo dar um CTRL+F e realizar a busca pelo nome do workflow que você deseja associar;
Após selecionar o Workflow, o Jira irá perguntar a qual issuetype você deseja associá-lo, marque a issuetype que receberá seu novo workflow e clique para avançar.
Depois disso, no topo da tela o Jira irá exibir uma opção chamada "Publish" e "Discard". Clique em "Publish" para avançar com a atribuição do novo workflow ao issuetype ou clique em "Discard" para cancelar a operação..
Aqui está a documentação deste assunto: https://support.atlassian.com/jira-cloud-administration/docs/configure-workflow-schemes/
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